Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABGGTAQ92696 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABGGTAQ92696 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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