Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3AQ92664 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms