Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUBCNQ92622 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms