Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASKIN2Q8WXE0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASKIN2Q8WXE0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms