Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPF31Q8WWY3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms