Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG1Q8WTW3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG1Q8WTW3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms