Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA6DQ8NFY4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms