Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL22A1Q8NFW1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL22A1Q8NFW1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL22A1Q8NFW1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms