Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE22Q8NFJ8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE22Q8NFJ8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms