Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC9Q8NEP7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms