Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC197Q8NCU1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC197Q8NCU1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms