Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ARRDC4Q8NCT1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARRDC4Q8NCT1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
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