Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECAB1Q8N987 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECAB1Q8N987 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms