Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms