Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYCP3Q8IZU3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYCP3Q8IZU3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms