Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR49Q8IV35 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR49Q8IV35 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR49Q8IV35 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR49Q8IV35 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR49Q8IV35 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR49Q8IV35 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR49Q8IV35 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR49Q8IV35 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR49Q8IV35 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR49Q8IV35 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR49Q8IV35 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR49Q8IV35 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms