Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPFIBP1Q86W92 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms