Protein–RNA interactions for Protein: Q86U38

NOP9, Nucleolar protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP9Q86U38 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP9Q86U38 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP9Q86U38 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms