Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01551Q86U37 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01551Q86U37 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms