Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG4DQ86TL0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms