Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT28Q7Z3Y7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT28Q7Z3Y7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms