Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDXQ7Z353 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDXQ7Z353 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms