Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP43Q70EL4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP43Q70EL4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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