Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
XIRP1Q702N8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XIRP1Q702N8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms