Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VITQ6UXI7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VITQ6UXI7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms