Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C16orf54Q6UWD8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf54Q6UWD8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms