Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TSSK4Q6SA08 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSSK4Q6SA08 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms