Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOA5Q6Q788 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms