Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC137Q6PK04 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms