Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNIP4Q6PIL6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms