Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC41PQ6P2S7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms