Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1Q6P1K2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1Q6P1K2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms