Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFCAB12Q6NXP0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFCAB12Q6NXP0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms