Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGMBQ6NW40 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGMBQ6NW40 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms