Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RWDD4Q6NW29 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RWDD4Q6NW29 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms