Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCSD1Q6JBY9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCSD1Q6JBY9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms