Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
USPL1Q5W0Q7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USPL1Q5W0Q7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms