Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ECM29Q5VYK3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms