Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BROXQ5VW32 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BROXQ5VW32 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms