Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFMBT2Q5VUG0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFMBT2Q5VUG0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFMBT2Q5VUG0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFMBT2Q5VUG0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFMBT2Q5VUG0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFMBT2Q5VUG0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SFMBT2Q5VUG0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFMBT2Q5VUG0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT2Q5VUG0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFMBT2Q5VUG0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms