Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MEX3CQ5U5Q3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms