Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT6Q5T7P8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYT6Q5T7P8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms