Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SNAPC4Q5SXM2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SNAPC4Q5SXM2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SNAPC4Q5SXM2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SNAPC4Q5SXM2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SNAPC4Q5SXM2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SNAPC4Q5SXM2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
SNAPC4Q5SXM2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SNAPC4Q5SXM2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SNAPC4Q5SXM2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms