Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUP188Q5SRE5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms