Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACER2Q5QJU3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms