Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12AQ5D1E8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZC3H12AQ5D1E8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms