Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HS1BP3Q53T59 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS1BP3Q53T59 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms