Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC92Q53HC0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC92Q53HC0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms