Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP221Q4G0U5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP221Q4G0U5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms