Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP100Q494V2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP100Q494V2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
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